Un estudi recent publicat aMicrobiomavan dur a terme una anàlisi metagenòmica viral en 846 petits mamífers salvatges —inclosos ratpenats, rosegadors i musaranyes— recollits a Sierra Leone, Àfrica Occidental. L'estudi va identificar un total de 39 virus d'ARN associats a mamífers, que comprenen 26 virus nous i 13 virus coneguts anteriorment. Entre aquests, la família Paramyxoviridae va exhibir la diversitat més alta, mentre que els rosegadors albergaven el nombre més gran d'espècies virals (n = 26).
L'avaluació del risc zoonòtic va revelar tres virus zoonòtics coneguts: el virus de l'encefalomiocarditis, el virus de Lassa i el Rocahepevirus sp., així com tres virus amb risc potencial de contagi: el virus de Melian, el virus de l'hepatitis en rosegadors i el Hunnivirus A. Cal destacar que, entre els virus recentment identificats, el Bat ledantevirus 2 va mostrar la relació filogenètica més propera amb el virus Le Dantec, que infecta els humans. L'anàlisi serològica va detectar, a més, anticossos neutralitzants contra aquest virus en el 2,8% dels residents locals, cosa que suggereix una exposició humana prèvia, probablement no detectada.
Aquestes troballes destaquen la presència d'un reservori viral substancial dominat per rosegadors a l'Àfrica Occidental i subratllen la importància crítica de les estratègies de vigilància integrada a la interfície humà-animal. La combinació del cribratge metagenòmic amb la validació serològica proporciona un marc robust per identificar virus amb potencial zoonòtic i de contagi.
Durant l'última dècada, més del 60% de les malalties infeccioses emergents en humans s'han originat en reservoris animals, i els ratpenats, els rosegadors i les musares són reconeguts com a hostes clau dels virus zoonòtics. Àfrica es considera àmpliament un punt crític per a les malalties zoonòtiques. Per exemple, Sierra Leone va reportar més de 28.000 casos durant el brot d'Ebola del 2014-2016.
Malgrat la important càrrega de malalties zoonòtiques en aquesta regió, la diversitat i la distribució de virus en petits mamífers salvatges encara no estan prou caracteritzades. Per abordar aquesta mancança, els investigadors van dur a terme una anàlisi sistemàtica de viromes de 846 petits mamífers salvatges capturats en tres llocs de Sierra Leone entre el 2018 i el 2023. L'estudi tenia com a objectiu caracteritzar la diversitat viral, identificar candidats amb potencial de transmissió entre espècies, avaluar el risc zoonòtic i generar proves per donar suport als sistemes d'alerta precoç per a malalties infeccioses emergents.
Mètodes bàsics
L'estudi va aplicar un flux de treball complet de metagenòmica viral:
- Processament de mostres:Es van recollir, agrupar, homogeneïtzar i sotmetre a extracció total d'ARN els teixits del cor, el fetge, la melsa, els pulmons i els ronyons.
- Seqüenciació i muntatge:L'esgotament de l'ARN ribosòmic es va dur a terme abans de la construcció de la biblioteca, seguit d'una seqüenciació d'alt rendiment mitjançant la plataforma Illumina NovaSeq 6000. Els contigs virals es van assemblar de novo.
- Identificació de virus:Els virus es van identificar basant-se en l'alineació del gen de l'ARN polimerasa dependent d'ARN (RdRp). Només es van retenir els virus associats a vertebrats, excloent els virus bacterians, fúngics i vegetals.
- Anàlisi bioinformàtica:Es van dur a terme reconstruccions filogenètiques, anàlisis de recombinació, modelització de xarxes de transmissió entre espècies i avaluació de riscos zoonòtics.
- Validació serològica:Es va desenvolupar un assaig de neutralització de pseudovirus basat en VSV per al Bat ledantevirus 2. Es van detectar anticossos neutralitzants en el 2,8% dels sèrums humans, cosa que proporciona evidència d'una possible transmissió zoonòtica.
EstudiResultats
1. Descobriment i diversitat viral
Aquest estudi va dur a terme una anàlisi de seqüenciació transcriptòmica en 846 animals salvatges recollits a Sierra Leone, incloent-hi rosegadors, ratpenats i musaranyes. Basant-se en les seqüències completes del gen de l'ARN polimerasa dependent d'ARN (RdRp), es van identificar un total de 39 virus d'ARN associats a mamífers, que comprenen 13 virus prèviament coneguts i 26 virus nous.
Pel que fa a la composició viral, la família Paramyxoviridae va exhibir el nivell més alt de diversitat en els tres ordres d'hostes, seguida d'Astroviridae i Picornaviridae. Pel que fa a la distribució dels hostes, els rosegadors van contribuir amb la major diversitat viral, albergant un total de 26 espècies de virus, cosa que indica el seu paper destacat com a reservoris de diversitat viral a la regió.
2. Risc zoonòtic
L'avaluació del risc zoonòtic va identificar tres virus zoonòtics coneguts: el virus de l'encefalomiocarditis, el virus de Lassa i les espècies de Rocahepevirus. A més, es van identificar tres virus (el virus de Melian, el virus de l'hepatitis dels rosegadors i el Hunnivirus A) amb un risc potencial de contagi.
Entre els 26 virus recentment descoberts, es preveia que quatre posseïen un alt potencial zoonòtic basant-se en les característiques filogenètiques i genòmiques. Cal destacar que el Bat ledantevirus 2 va mostrar la relació filogenètica més propera amb el virus Le Dantec, que infecta humans i que es coneix.
Investigacions serològiques posteriors van corroborar encara més aquesta troballa, ja que es van detectar anticossos neutralitzants contra el Bat ledantevirus 2 en el 2,8% dels sèrums dels residents locals. Aquest resultat suggereix que infeccions no reconegudes o asimptomàtiques ja poden haver ocorregut dins de la població humana, cosa que destaca una via de transmissió zoonòtica potencial però no detectada prèviament.
3. Dinàmica de transmissió entre espècies
L'anàlisi de transmissió entre espècies va demostrar que els rosegadors ocupen una posició central dins de la xarxa de compartició viral, actuant com a nodes clau que faciliten l'intercanvi viral entre espècies hostes. Es van identificar un total de 15 virus amb potencial per a la transmissió entre espècies.
Una anàlisi més detallada dels patrons de transmissió creuada va indicar que la compartició viral es produïa amb més freqüència entre hostes dins del mateix ordre taxonòmic, cosa que suggereix que la relació de l'hoste juga un paper important en la dinàmica de transmissió. En canvi, els ratpenats van mostrar una capacitat relativament menor per a la transmissió creuada.
És important destacar que es van observar proves d'expansió de la gamma d'hostes en certs virus. Per exemple, el virus Melian, que anteriorment s'havia considerat específic de les musaranyes, també es va detectar en rosegadors en aquest estudi, cosa que indica un possible canvi en l'adaptabilitat de l'hoste i un major risc de transmissió més àmplia.
Conclusions i implicacions per a la salut pública
- Alta diversitat de viromes en petits mamífers salvatges:El descobriment de 39 virus d'ARN, incloent-hi 26 espècies noves, revela un gran reservori de virus a la regió i informa per primera vegada de nous virus amb un alt potencial zoonòtic (per exemple, el Bat ledantevirus 2).
- Rosegadors com a objectius de vigilància prioritaris:Els rosegadors actuen com a centres clau per a la transmissió viral i són portadors de la diversitat viral més alta, representant el risc de contagi més gran.
- Necessitat d'estratègies de vigilància integrades:Les troballes donen suport a la priorització dels rosegadors en els programes de vigilància activa i a la implementació d'enfocaments integrats que combinin metagenòmica, serologia i monitorització ecològica a les interfícies humà-fauna salvatge.
En general, aquest estudi proporciona evidència crítica per donar suport als sistemes d'alerta precoç i als marcs d'avaluació de riscos per a malalties zoonòtiques emergents, cosa que reforça la importància de la vigilància proactiva a les regions d'alt risc.
Informació del producte
Data de publicació: 23 de març de 2026