Una nova arma per al diagnòstic de la tuberculosi i la detecció de la resistència als fàrmacs: una seqüenciació dirigida a la nova generació (TNG) combinada amb l’aprenentatge automàtic per al diagnòstic d’hipersensibilitat de la tuberculosi
Informe de literatura: CCA: un model de diagnòstic basat en TNG i aprenentatge automàtic, adequat per a persones amb menys tuberculosi bacteriana i meningitis tuberculosa.
Títol de la tesi: seqüenciació de la nova generació i aprenentatge de màquines orientades a la tubercul: una estratègia de diagnòstic ultra-sensible per a tubulars pulmonars paucífics i meningitis tubular.
Periòdic: 《Clinica Chimica Acta》
Si ： 6.5
Data de publicació: gener de 2024
Combinat amb la Universitat de l'Acadèmia de Ciències de la Universitat de Ciències i Beijing Hospital de la Universitat Mèdica de Capital Medical, Macro & Micro-Test va establir un model de diagnòstic de tuberculosi basat en la nova generació de tecnologia de seqüenciació dirigida (TNGS) i mètode d'aprenentatge automàtic, que va proporcionar un alt alt nivell La sensibilitat a la detecció de la tuberculosi amb pocs bacteris i meningitis tuberculosa, va proporcionar un nou mètode de diagnòstic d’hipersensibilitat per al diagnòstic clínic de dos tipus de tuberculosi i van ajudar al diagnòstic precís, la detecció de la resistència als fàrmacs i el tractament de la tuberculosi. Al mateix temps, es troba que l’ADNc plasmàtic del pacient es pot utilitzar com a tipus de mostra adequat per al mostreig clínic en el diagnòstic de TBM.
En aquest estudi, es van utilitzar 227 mostres de plasma i mostres de líquids cefalorraquidi per establir dues cohorts clíniques, en què es van utilitzar les mostres de cohort de diagnòstic de laboratori per establir el model d'aprenentatge automàtic del diagnòstic de tuberculosi i es van utilitzar les mostres de cohort clínica per verificar els establerts establerts en aquest diagnòstic de diagnòstic. Model de diagnòstic. Totes les mostres es van orientar per primera vegada amb un conjunt de sondes de captura dirigida especialment dissenyada per a Mycobacterium tuberculosis. A continuació, basant-se en dades de seqüenciació de TB-TNGS, el model de l’arbre de decisió s’utilitza per realitzar una validació creuada de 5 vegades en els conjunts de formació i validació de la cua de diagnòstic de laboratori i s’obtenen els llindars de diagnòstic de mostres de plasma i mostres de líquids cerebridi. El llindar obtingut es incorpora en dos conjunts de proves de cua de diagnòstic clínic per a la detecció i el rendiment diagnòstic de l’aprenent s’avalua mitjançant la corba ROC. Finalment, es va obtenir el model de diagnòstic de tuberculosi.
Fig. 1 Esquema esquemàtic del disseny de la investigació
Resultats: Segons els llindars específics de la mostra d’ADN CSF (AUC = 0,974) i la mostra de l’ADNc plasmàtic (AUC = 0,908) determinades en aquest estudi, entre 227 mostres, la sensibilitat de la mostra de CSF va ser del 97,01%, l’especificitat va ser del 95,65%i La sensibilitat i l’especificitat de la mostra de plasma van ser del 82,61% i del 86,36%. En l'anàlisi de 44 mostres aparellades de CFDNA plasmàtica i ADN de fluids cefalorraquidi a partir de pacients amb TBM, l'estratègia diagnòstica d'aquest estudi té una alta consistència del 90,91% (40/44) en CFDNA plasmàtic i l'ADN de fluids cerebrospinals i la sensibilitat és del 95,45% del plasma i el fluid cerebrospinal és del 95,45% (42/44). En nens amb tuberculosi pulmonar, l’estratègia de diagnòstic d’aquest estudi és més sensible a les mostres de plasma que els resultats de detecció XPERT de mostres de sucs de sucs gàstrics dels mateixos pacients (28,57% vs 15,38%).
Fig. 2 Anàlisi Rendiment del model de diagnòstic de la tuberculosi per a mostres de població
