Recentment,Setmanari dels CDC de la Xinava publicar un important article de recerca que descrivia la investigació epidemiològica i etiològica d'un brot de gastroenteritis aguda causat pel rotavirus del grup C (RVC) en una escola primària de Luzhou, província de Sichuan, a l'octubre de 2025. Cal destacar que el kit de captura de patògens dirigits d'alt rendiment (captura amb sonda) i la tecnologia de seqüenciació d'enriquiment de genoma complet de Macro & Micro-Test van tenir un paper fonamental en la investigació. En permetre una identificació precisa de patògens i una caracterització genòmica completa, la tecnologia va proporcionar proves científiques crítiques per a la confirmació ràpida del brot, la localització precisa de la font i un control eficaç del brot.
Brot sobtat: primer brot de RVC reportat al sud-oest de la Xina
El 15 d'octubre de 2025, es va produir un brot de gastroenteritis aguda en una escola primària de Luzhou. L'escola tenia una població total de 1.943 estudiants i personal, amb 32 casos notificats, incloent-hi 6 casos confirmats per laboratori i 26 casos diagnosticats clínicament, cosa que va resultar en una taxa d'atac global de l'1,65%. El brot va assolir el pic entre el 15 i el 16 d'octubre, i la classe 7, grau 5, va experimentar la taxa d'atac més alta (23,08%). La majoria dels pacients eren nens en edat escolar (edat mitjana: 10 anys), que presentaven principalment vòmits (65,62%), diarrea (46,87%) i dolor abdominal (37,50%). Els símptomes solien durar d'1 a 3 dies, i tots els pacients es van recuperar sense complicacions greus.
La investigació epidemiològica va identificar el cas índex com un nen d'11 anys de 7è de primària. La seva germana petita havia desenvolupat símptomes similars abans que ell, cosa que suggereix que la transmissió domèstica era la font inicial. Una gestió inadequada dels vòmits al campus —inclosa l'escombrada i l'eliminació directa sense una desinfecció o aïllament de la zona a temps—, combinada amb una higiene deficient de mans entre els estudiants, probablement va facilitar una major transmissió. La majoria de les aules afectades estaven situades entre la segona i la cinquena planta i compartien lavabos masculins adjacents, cosa que indica que tant la transmissió per aerosols com la per contacte poden haver contribuït a la propagació.
La investigació es va tornar particularment difícil perquè el cribratge rutinari de patògens, incloent-hi proves de norovirus i rotavirus del grup A, va donar resultats negatius, cosa que indica que el responsable era un patogen poc comú.
Diagnòstic etiològic: la seqüenciació del genoma complet de Macro & Micro-Test identifica el culpable
Les proves inicials per al norovirus van ser negatives. Posteriorment, els CDC de Luzhou van utilitzar un assaig de PCR en temps real de patògens gastrointestinals multiplex capaç de detectar simultàniament 28 patògens, inclosos 8 virus, 17 bacteris i 3 paràsits, per examinar vuit mostres clíniques. El 17 d'octubre, sis mostres van donar positiu per al rotavirus del grup C, identificant amb èxit el patogen causant.
Per rastrejar més a fons l'origen del brot, els investigadors van realitzar tant la seqüenciació metagenòmica de nanoporus com la seqüenciació d'enriquiment del genoma complet amb captura de sondes de Macro & Micro-Test en cinc mostres positives. Aquest enfocament va generar amb èxit cinc seqüències completes del genoma del virus de la vírica recurrent (RCV) (SC01-SC05). L'estratègia integrada de cribratge ràpid per PCR multiplex seguit de seqüenciació del genoma complet d'alta resolució va proporcionar un suport tècnic robust per a una epidemiologia molecular precisa i un rastreig de l'origen.
Perspectives científiques: primera identificació del genotip M2 al sud-oest de la Xina
Basant-se en les dades d'alta qualitat del genoma complet generades amb la tecnologia de Macro & Micro-Test, l'equip de recerca va informar de diverses troballes científiques importants:
Confirmació d'un brot monoclonal:Els cinc aïllats virals compartien un genotip idèntic de tot el genoma (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), amb només 0-1 diferències en el polimorfisme de nucleòtid únic (SNP), cosa que demostra de manera concloent que el brot es va originar a partir d'una única cadena de transmissió.
Descobriment del genotip M2:L'anàlisi filogenètica va revelar que les soques de RVC de Luzhou pertanyien al genotip M2 en lloc del genotip M3 que anteriorment es considerava predominant entre les soques de RVC xineses. Aquesta troballa qüestiona la comprensió convencional de la distribució del genotip de RVC a la Xina i confirma l'aparició del genotip M2 al sud-oest de la Xina.
Evidència d'enllaços de transmissió internacionals:La comparació de tot el genoma va demostrar una alta similitud genètica entre les soques de Luzhou i les soques de RVC descrites anteriorment a Yunnan (2025), Novosibirsk, Rússia (2017) i Itàlia (2012), cosa que suggereix l'existència d'una xarxa de transmissió euroasiàtica activa.
Implicacions per a la prevenció i el control: la detecció precoç i la intervenció ràpida són essencials
Després de la identificació del patògen, els CDC de Luzhou van implementar immediatament mesures de control integrals, com ara l'aïllament de casos, la desinfecció ambiental, la gestió estandarditzada dels vòmits i la suspensió temporal de la classe. El brot es va contenir amb èxit en un únic període d'incubació, sense que es notifiquessin casos addicionals després del 21 d'octubre.
La investigació també proporciona una important lliçó de salut pública: per als brots de gastroenteritis agrupats que donen negatiu tant per al rotavirus del grup A com per al norovirus, el rotavirus del grup C i altres rotavirus que no són del grup A s'han d'incorporar al cribratge diagnòstic rutinari.
Aquest estudi representa el primer brot de rotavirus del grup C reportat al sud-oest de la Xina i la primera identificació del genotip M2 a la regió, ampliant la comprensió actual de l'epidemiologia del rotavirus del grup C a l'Àsia oriental. En aquesta investigació, la solució integrada de Macro & Micro-Test que combina el cribratge per PCR multiplex amb la seqüenciació d'enriquiment de tot el genoma va demostrar un valor pràctic significatiu en permetre tant la identificació ràpida de patògens com el rastreig de fonts moleculars d'alta resolució, proporcionant un marc tècnic reproduïble per a la investigació i el control precisos de futurs brots de malalties infeccioses.
Data de publicació: 30 de juliol de 2026